Naxçıvan Dövlət Universitetinin Elmi Kitabxanası universitetin oxucuların elmi araşdırma aparması və informasiya əldə etməsi üçün geniş imkanlara malik olan bir strukturudur. Kitabxanada kitab, jurnal və digər informasiya mənbələrinə giriş və istifadənin təşkili həm ənənəvi, həm də elektron formada həyata keçirilir. Kitabxanada sorğusu həyata keçirilən müvafiq informasiya mənbələrinin axtarışı, dərslik, dərs vəsaiti və digər materiallardan, həmçinin elmi-tədqiqat və araşdırma zamanı geniş çap və elektron materiallardan istifadə təmin edilir, eləcə də onlayn sorğular cavablandırılır. Kitabxananın fondunda 100 mindən çox kitab, monoqrafiya, dərslik, soraq-biblioqrafiya materialları, dövri nəşrlər, dissertasiyalar və digər çap materialları, eyni zamanda alimlərin şəxsi kitabxanalarından kitabxanaya hədiyyə etdikləri qiymətli kitab kolleksiyaları mövcuddur.